Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test
La vigilancia de las aguas residuales para el SARS-CoV-2 se está usando en todo el mundo como una importante herramienta epidemiológica debido a la pandemia de la COVID-191,2.
La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua es una prueba de reacción en cadena cuantitativa de la polimerasa de transcripción inversa (RT-qPCR) que detecta y cuantifica el ARN del virus SARS-CoV-2 en aguas residuales no tratadas. Apoyado por amplios datos de validación y empleado por laboratorios de todo el mundo, este kit puede ayudar a los departamentos de salud pública, a los investigadores y a las universidades a proteger a las comunidades3.
Resumen
Validado
- Protocolo validado por el fabricante de las pruebas en agua residual líderes del mercado, que incluyen el método Colilert/Quanti-Tray
- Protocolo con flexibilidad integrada para una matriz de alto dinamismo
- Validación en instrumentos de RT-qPCR comunes3
- Validado con los controles de calidad recomendados por el Sistema Nacional de Vigilancia de Aguas Residuales (NWSS) estadounidense de los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades (CDC)
- Datos de validación de diversas instalaciones de tratamiento de aguas residuales de diferentes zonas geográficas
Coherente
- Coherencia demostrada y limitada variación metodológica para apoyar la confianza en los datos de tendencias
- Testado de forma independiente por múltiples estudios entre laboratorios, incluyendo el de la Water Research Foundation (Fundación de Investigación del Agua, WRF)
Disponible
- Empleado en todo el mundo por la sanidad pública y los laboratorios privados
- Historia de una excelente cadena de suministro: IDEXX Water tiene una disponibilidad de más del 99,9 % de productos clave3
- Personal de apoyo técnico con experiencia en la implantación de la vigilancia de las aguas residuales
Modo de empleo
Concentración
Extracción de ARN
PCR en tiempo real
Paso 1 Pasteurizar la muestra a 60 °C durante 1,5 horas. Este paso es opcional.
Paso 2 Concentrar la muestra por precipitación PEG o su equivalente.
Paso 3 Extraiga el ARN utilizando el kit de perlas magnéticas para ADN/ARN.
Paso 4 Amplificar los ácidos nucleicos purificados utilizando la Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test.
Prospectos del producto y documentos de respaldo
Más información sobre la Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test
Rellene el formulario que aparece a continuación; uno de nuestros especialistas se pondrá en contacto con usted para explicarle nuestras soluciones sencillas para la protección de la salud pública.
Preguntas frecuentes
Agua residual sin tratar que no ha sido químicamente tratado.
La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua es una prueba de reacción en cadena cuantitativa de la polimerasa de transcripción inversa (RT-qPCR) que detecta y cuantifica el ARN viral en una muestra concentrada de agua residual adecuadamente preparada.
Cuando se utiliza con el protocolo de concentración de 105 ml, la concentración más baja de SARS-CoV-2 en aguas residuales que se puede detectar con la prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua es de aproximadamente 1 copia de gen/1 ml.
Al usarse con el procedimiento de extremo a extremo de IDEXX, la prueba de IDEXX se ha validado para proporcionar una recuperación altamente coherente de SARS-CoV-2 en aguas residuales.
El protocolo validado por IDEXX concentra el virus SARS-CoV-2 a partir de 105 ml de agua residual. El personal de laboratorio puede analizar mayores o menores volúmenes de agua, realizando el procedimiento básico adaptado para diferentes volúmenes de entrada con los equipos de centrifugación adecuados.
La Water SARS-CoV-2 RT-PCR Test analiza 5 µL de ARN extraído, preparado a partir de una muestra concentrada de agua residual, aunque recomendamos tener un volumen adicional a mano para compensar las pérdidas durante el pipeteo y las muestras duplicadas.
IDEXX proporciona un ejemplo de protocolo de concentración basado en la centrifugación y la precipitación con polietilenglicol (PEG) que se ha validado para proporcionar resultados coherentes. Este protocolo se puede modificar para cumplir con las necesidades específicas de su laboratorio. También se pueden usar otros métodos de concentración, como la ultrafiltración, la filtración a través de membranas, etc., y los clientes han usado con éxito estos métodos de concentración con reactivos de IDEXX. Estos deben ser validados para verificar el rendimiento.
El mantenimiento de las muestras a bajas temperaturas ayuda a prevenir la degradación de las muestras y a asegurar la precipitación eficiente del virus SARS-CoV-2.
La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua ha sido validada para el uso con el IDEXX Water DNA/RNA Magnetic Bead Kit para la extracción de ácidos nucleicos, incluido ARN de SARS-CoV-2, a partir de concentrado de agua residual. También se pueden usar otros kits de extracción con la prueba; los clientes han empleado con éxito otros kits con los reactivos RT-qPCR de IDEXX.
Las aguas residuales son una matriz extremadamente compleja, y la vigilancia de las aguas residuales requiere materiales de control exhaustivos. Consulte el informe Complete IDEXX Wastewater Surveillance Procedure con el fin de obtener una descripción completa del procedimiento de extremo a extremo y los controles requeridos y recomendados.
Consulte los prospectos del producto para ver las condiciones de almacenamiento recomendadas al momento de recibir el producto y después de la reconstitución / primer uso.
Los Centros de Control y Prevención de Enfermedades (CDC) de Estados Unidos indican que se puede usar un laboratorio con nivel de bioseguridad 2 (BSL-2) con precauciones adicionales para el análisis de muestras ambientales, incluidos la manipulación y el procesamiento de muestras de agua residual asociados al SARS-CoV-2. Se dispone de orientación específica en los CDC de EE. UU.: Directrices interinas de bioseguridad de laboratorio para la manipulación y el procesamiento de especímenes asociados con la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19).4
Consulte a sus autoridades sanitarias locales para obtener recomendaciones específicas.
Siga los procedimientos recomendados por las autoridades sanitarias locales para la manipulación y el procesamiento de muestras de agua residual asociadas con SARS-CoV-2. Los CDC de EE. UU. publican una fuente de información: Directrices interinas de bioseguridad de laboratorio para la manipulación y el procesamiento de especímenes asociados con la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19).4
Siga todas las directrices normativas y de seguridad locales.
Se puede usar un proceso opcional de tratamiento con calor para inactivar las muestras durante la pasteurización. Consulte el prospecto del producto para ver un ejemplo.
La fase de pasteurización puede reducir la detección de ARN de SARS-CoV-2. Contacte al representante de IDEXX para obtener información adicional.
Deseche todas las muestras y materiales de conformidad con las directrices normativas locales.
La prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua no está autorizada por la EPA de EE. UU. para la detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales. La EPA de EE. UU. actualmente no regula las pruebas de detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales ni aprueba los métodos de prueba para este fin. Las pruebas de detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales podrían estar reguladas o no por sus autoridades locales o municipales. Compruebe la existencia de regulaciones que podrían aplicarse en su área.
Sí, la prueba RT-PCR de SARS-CoV-2 en agua es compatible con —o incluye— todos los controles y procesos recomendados por el CDC para el envío de datos al NWSS. Consulte el informe Complete IDEXX Wastewater Surveillance Procedure con el fin de obtener una descripción completa del procedimiento de extremo a extremo, que incluye todos los controles requeridos y recomendados.
Más información sobre la prueba RT-PCR para SARS-CoV-2 en agua
Atención al cliente del área de análisis de agua
Oficinas en Estados Unidos
IDEXX Laboratories, Inc.
One IDEXX Drive
Westbrook, Maine 04092 USA
Tel: 1(207)556-4472 | 1(207)556-3812
Water International
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Latin America
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United Kingdom
Certificaciones ISO
Referencias
- Wurtzer S, Marechal V, Mouchel J-M, et al. Evaluation of lockdown impact on SARS-CoV-2 dynamics through viral genome quantification in Paris wastewaters [preprint posted May 6, 2020]. medRxiv. doi:10.1101/2020.04.12.20062679
- Medema G, Heijnen L, Elsinga G, Italiaander R, Brouwer A. Presence of SARS-Coronavirus-2 in sewage [preprint posted March 30, 2020]. medRxiv. doi:10.1101/2020.03.29.20045880
- Data on file at IDEXX Laboratories, Inc. Westbrook, Maine USA.
- Centers for Disease Control and Prevention. Interim laboratory biosafety guidelines for handling and processing specimens associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/lab-biosafety-guidelines.html. Revised June 3, 2020. Accessed July 7, 2020.